Os valores de contrapartida, visam compensar as Associações de Municípios e os Sistemas Multimunicípais, pelos acréscimos de custos resultantes da recolha seletiva das pilhas e acumuladores usados, a Ecopilhas paga aos primeiros, o Valor de Contrapartida, definido na sua licença pelo Ministério do Ambiente e Ordenamento do Território.

Este valor poderá ser revisto, sendo actualmente de 46,65 € por tonelada de pilhas e acumuladores usados recolhidos.